سید علی میرفخرایی پیش از این در سمتهای معاونت فرهنگی اداره کل روابط عمومی بانک توسعه تعاون، مشاور مدیرعامل و مدیر حوزه مدیریت و روابط عمومی صندوق مهر امام رضا علیه السلام (صندوق فعلی کار آفرینی امید). مشاور مدیر عامل در امور جوانان ، مدیر دفتر نمایندگی استانداری مازندران در تهران وزارت کشور ، مشاور مدیر عامل و رئیس دفتر مدیر عامل صندوق تعاون کشور، مدیر روابط عمومی دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران مرکزی و مدیر روابط عمومی دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرری فعالیت داشته است.
وی در حال حاضر معاون فرهنگی پایگاه بسیج شهید رجائی و عضو فعال بسیج ، دبیر ستاد اقامه نماز و شورای امر به معروف و نهی از منکر بانک توسعه تعاون نیز می باشد .
میرفخرایی سردبیر نشریه مهر هشتم و عضوشورای فرهنگی صندوق مهر امام رضا علیه الاسلام بوده و اکنون مدیر مسئول ماهنامه توسعه تعاون است .
وی تجربه همکاری با حوزه مشاوران جوان وزارت تعاون، کار و رفاه اجتماعی را نیزدر کارنامه خود دارد.
